1.不同的培養目標和方向
在本科水平上，專業碩士與普通碩士相同，但培養目標明顯不同。
其突出特點是學者型與職業型緊密結合，重視實踐和應用，重視技術人才培養，一般碩士學位以學科設置、學術研究為主，重視理論研究，重視理論人才培養。
專業碩士課程的教學內容強調理論與應用課程的有機結合，強調案例分析與實踐研究，一般碩士研究生重視加強基礎理論學習，重視培養學生從事科研創新的能力和素質。
二是入學專業不同
碩士和招生專業很多，只有財務、應用統計、稅務、國際商務等40個專業。
普通碩士專業包括哲學、經濟、法學、教育學、文字學等13個學科，其次是一級、二級學科，復蓋各專業的方向。
三、不同的調劑要求
碩士學位的考試科目通常可以覆蓋碩士研究生的初試科目或難度范圍，因此，調整通常是從普通碩士學位轉移到專業碩士學位，而專業碩士學位不能轉移到普通碩士學位。
四、學制不同
普通碩士學位制度為2-3年，普通碩士學位制度為3年。具體情況以當年招生單位政策為準。
五、教師制度不同
碩士生實行雙導師制，在培訓過程中，校內教師主要教授理論知識和學術指導，校外教師主要注重技術培訓和實踐指導。
普通碩士生實行單一教師制，主要指導學生理論學習和論文完成。
6.學位論文不同
研究生論文主要是加強應用指導，如研究報告、規劃設計、產品開發、案例分析等具有較高實用價值的論文，與普通碩士研究生相比，它們更傳統，主要是科研和學術論文。
